Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tp53bp1P70399 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tp53bp1P70399 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms