Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usp9xP70398 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usp9xP70398 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usp9xP70398 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usp9xP70398 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usp9xP70398 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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