Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Msx3P70354 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Msx3P70354 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Msx3P70354 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Msx3P70354 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Msx3P70354 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms