Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gfi1P70338 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gfi1P70338 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms