Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Chl1P70232 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chl1P70232 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chl1P70232 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms