Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf5P70191 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Traf5P70191 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms