Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Acta1P68134 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acta1P68134 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acta1P68134 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms