Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rps3P62908 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rps3P62908 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rps3P62908 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms