Protein–RNA interactions for Protein: P62900

Rpl31, 60S ribosomal protein L31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl31P62900 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rpl31P62900 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rpl31P62900 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl31P62900 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl31P62900 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl31P62900 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rpl31P62900 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rpl31P62900 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rpl31P62900 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rpl31P62900 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl31P62900 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl31P62900 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl31P62900 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl31P62900 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rpl31P62900 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rpl31P62900 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms