Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps25P62852 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps25P62852 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms