Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabra1P62812 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms