Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snrpd1P62315 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Snrpd1P62315 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms