Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rps11P62281 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rps11P62281 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps11P62281 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps11P62281 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms