Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rps29P62274 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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