Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan5P62080 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan5P62080 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms