Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrch1P62046 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch1P62046 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch1P62046 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch1P62046 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch1P62046 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrch1P62046 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrch1P62046 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lrch1P62046 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lrch1P62046 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Lrch1P62046 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrch1P62046 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms