Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg6P61406 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg6P61406 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg6P61406 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg6P61406 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms