Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psme3P61290 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme3P61290 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme3P61290 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme3P61290 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme3P61290 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psme3P61290 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms