Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nup43P59235 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms