Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Scarf2P59222 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Scarf2P59222 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms