Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhbdl3P58873 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhbdl3P58873 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhbdl3P58873 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms