Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Paxbp1P58501 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Paxbp1P58501 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms