Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NcstnP57716 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NcstnP57716 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms