Protein–RNA interactions for Protein: P56716

Rp1, Oxygen-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp1P56716 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rp1P56716 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rp1P56716 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms