Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Lim2P56563 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lim2P56563 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms