Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ctbp2P56546 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ctbp2P56546 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms