Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cox7bP56393 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms