Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rrp1P56183 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rrp1P56183 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms