Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pex2P55098 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pex2P55098 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms