Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ephb3P54754 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ephb3P54754 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms