Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacnb3P54285 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacnb3P54285 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms