Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PitpnbP53811 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.7 ms