Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Map3k1P53349 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Map3k1P53349 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Map3k1P53349 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms