Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ClgnP52194 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ClgnP52194 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms