Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ApodP51910 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ApodP51910 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApodP51910 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApodP51910 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms