Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TspoP50637 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TspoP50637 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TspoP50637 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TspoP50637 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TspoP50637 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms