Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxc13P50207 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxc13P50207 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms