Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtpreP49446 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PtpreP49446 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PtpreP49446 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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