Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ercc3P49135 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ercc3P49135 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ercc3P49135 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ercc3P49135 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms