Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rfx1P48377 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfx1P48377 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms