Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
VdrP48281 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
VdrP48281 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VdrP48281 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VdrP48281 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VdrP48281 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VdrP48281 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VdrP48281 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VdrP48281 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
VdrP48281 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
VdrP48281 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms