Protein–RNA interactions for Protein: P47753

Capza1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capza1P47753 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Capza1P47753 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms