Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syt1P46096 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms