Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Tnfsf4P43488 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnfsf4P43488 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms