Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlx1P43345 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms