Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Egr3P43300 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Egr3P43300 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms