Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cdx2P43241 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdx2P43241 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms