Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PtgfrP43117 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms