Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LifrP42703 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LifrP42703 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LifrP42703 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LifrP42703 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LifrP42703 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LifrP42703 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LifrP42703 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LifrP42703 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LifrP42703 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LifrP42703 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LifrP42703 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LifrP42703 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LifrP42703 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LifrP42703 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms