Protein–RNA interactions for Protein: P42586

Nkx2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-2P42586 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkx2-2P42586 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx2-2P42586 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms